区别主要表现在如下几个方面：

一是经费来源上的区别，事业单位的经费按不同的种类，由国家财政或全部或部分或一点不负担，企业编制理论上不管国家财政什么事;

二是待遇和地位上的差别，事业编制无论是从工资、福利、升迁机会上来看，还是从社会地位上来看，都要大于企业编制;

三是职能职责上的区别，事业编制是体制内的，企业编制是体制外的，两者的职能、职责是不一样的。