怀化南站目前每天共有3趟高铁开往不同方向，分别是G1230次、G1246次和G1276次。其中，G1230次高铁始发于怀化南站，经过岳阳东、衡阳东等站，最终到达南昌西站；G1246次高铁则从广州南站出发，经过深圳北、东莞东、长沙南等站后抵达怀化南站，再前往长沙南站；G1276次高铁则始发于北京南站，经过郑州东、武汉等站，最终到达怀化南站，再终点到广州南站。 总体来说，怀化南站的高铁班次虽然不算很多，但覆盖了不同的方向，方便了旅客出行。