可以

灵活用工可以选择开具差额普票。

这种方式主要适用于小规模纳税人企业，可以以较低的成本获得相应的普通发票。具体来说，对于通过灵活用工模式支付给员工的金额部分，可以开具免税的普通发票，而服务费部分则开具6%的普通发票。