根据工商局的规定，所有公司年度报告必须在年度结束后的三个月内提交。因此，如果粤商通年度报告的截止日期在周末，则可以在周末进行提交。需要注意的是，应该提前安排好工作，确保周末时有足够的时间和资源来填写和提交报告。