因工受伤休息三个月公司赔偿方式如下：

医药费由用人单位全额垫付。

停工留薪期内工资按原待遇发放。

住院期间伙食补助费按由工伤职工所在地标准发放。

如经劳动能力鉴定为1-10级伤残的，还可以享受伤残津贴，一次性伤残补助金，一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金等待遇。

如果用人单位不履行上述的义务，工伤职工可以到当地劳动仲裁委员会提请仲裁申请，维护自己的合法权益。