对于申请工伤认定是没有关系的，不管公司是否为员工购买社保，在工作中受伤都可以申请工伤认定。

如果是报销工伤费用的话，可能有点影响，因为如果在发生工伤时没有买工伤保险，在后来才补交，那么在未补交工伤保险期间产生的费用由公司承担。