济宁医学院有硕士点，没有博士点1。

济宁医学院有临床医学一级学科的硕士专业学位授予点，招生专业包括内科学、外科学、儿科学、骨科学、急诊医学、肿瘤学、临床病理、耳鼻咽喉科学、临床检验诊断学等2。