合同后期补充的内容一般应该在补充协议中明确详细。如果这些内容已经被记录在书面合同之外，例如在电子邮件、短信或口头协议中，它们也可以被视为有效的补充约定。

如果在合同后期补充的内容在争议或法律纠纷中需要证明，法院或仲裁机构将会审查所有相关的文件和证据来确定这些内容是否真实存在和有效。

因此，建议在签订合同时尽可能在合同中将所有的细节都纳入，并在必要时及时补充协议以确保双方都有足够的合同保障。