在写毕业论文时，一般按照如下顺序撰写：封面-目录-声明-中英文摘要-正文-参考文献-致谢-附件。因此，在撰写毕业论文时，应先编写目录，然后再按照目录的顺序逐一撰写其他部分，最后完成正文部分。

如果您已经完成了正文，但尚未完成目录的编写，可以先在正文中先进行“标题层次、编号、页码”等标记，并在逐一查证各个章节页码的基础上，再根据规定的格式和要求进行目录的编写。

需要注意的是，目录是论文的重要组成部分之一，能够明确各章节的内容和页码，有利于读者对论文的阅读和理解。因此，在编写目录时，需要遵循规范、准确和完整的原则，确保内容的科学性和可读性。