1、外观不同

转基因玉米的外观比较像人的眼睛，而非转基因玉米的外观比较像发芽的大米。

2、营养价值不同

转基因玉米中含有丰富的维生素、蛋白质、氨基酸、矿物质等营养成分，而非转基因玉米中含有一定的蛋白质、碳水化合物、膳食纤维等营养成分。

3、安全性不同

转基因玉米中含有一定的毒素，如果长期食用，可能会给身体带来一定的损伤，而非转基因玉米经过专业的处理，一般不会对身体造成损伤。

4、产量不同

转基因玉米是由转基因的种子通过加工制成的，所以产量相对比较大。而非转基因玉米相对来说产量比较小，如果长期食用还可能会影响到其他的食物，导致营养摄入不足。

5、价格不同

转基因玉米由于是通过基因技术提取，所以价格相对比较高，而非转基因玉米相对来说产量比较低。