电子版合同应当整理成有序的文件夹，并按照时间或者重要性进行分类、命名。同时，还需要备份到云端或者其他安全的存储设备中，以保证数据的安全性和可靠性。此外，应当定期进行检查和更新，以确保合同的完整性和有效性。