常用方法包括苏木素 - 伊红染色法、高碘酸 - 无色品红法、改良的六胺银染色法、荧光染色法等。

这些染色方法主要用于观察真菌的形态、鉴别真菌的种类，同时也可用于真菌感染的病理诊断。

其中，苏木素 - 伊红染色法是最常用的真菌染色方法之一，它可以使真菌细胞壁和细胞核着色，提高真菌的辨认率。