口腔医院通常会根据医生使用的材料种类和数量来扣除医生的材料费。医生在治疗过程中会使用各种口腔材料，如牙科填充材料、牙套、牙冠等。

医院会根据材料的成本和市场价格制定相应的收费标准，并在患者就诊后结算时扣除医生的材料费用。

医生通常会在治疗前向患者解释材料费用，并在治疗后提供相应的收据和明细，以便患者了解和核对费用的合理性。