科学毛笔的笔头通常由合成纤维制成，如尼龙、聚酯等，具有弹性好、耐久性强、易清洗等优点。这种毛笔适合用于书写和绘画，尤其是在需要频繁更换笔头的场合，如绘画创作、书法练习等。
普通毛笔的笔头通常由动物毛发制成，如羊毫、狼毫等，具有柔软、弹性好、吸水性强等优点。这种毛笔适合用于书写和绘画，尤其是在需要表现笔触变化和细节的场合，如国画、书法等。
此外，科学毛笔和普通毛笔的笔杆也有所不同。科学毛笔的笔杆通常由合成材料制成，如塑料、金属等，具有轻便、耐用等优点。而普通毛笔的笔杆通常由木材、竹子等天然材料制成，具有一定的文化内涵和艺术价值。