魏无羡和蓝忘机在《陈情令》的故事里最终选择了隐居，并试图用自己的力量保护世间不再出现魔道的毒瘤。

他们选择舒缓心灵的方式并寻求内心的平静，而这样的归隐也使得他们可以安静地度过余生。因此，从故事情节来看，他们最后确实选择了归隐。