如果上海农村有两个户口但只有一处基地，可以考虑以下解决方案：

1.将两个户口合并为一个户口，以减少管理和使用基地的复杂性。

2.如果基地面积足够，可以考虑将基地划分为两个部分，分别供两个户口使用。

3.如果基地面积不够，可以与其他农户协商，共同使用基地，实现资源共享。

4.如果以上方案不可行，可以考虑出租或出售其中一个户口的基地，以获取经济收益。无论选择哪种方案，都需要与相关部门进行沟通和协商，确保合法合规。