海南社保扣款申报流程如下：

1. 注册与登记：首先，企业需要在海南社保官网或者到当地社保局进行注册。登记信息包括企业名称、组织机构代码、法人代表、经营地址等信息。登记完成后，可以获得社保局发放的社保登记证。

2. 办理扣款账户：企业需要开立一个银行账户，用于缴纳社保费用。前往企业开户银行，办理社保扣费协议，并与银行签订代扣代缴三方协议。

3. 增减员申报：企业发生人员变动时，需要及时向当地社保局申报增减员信息。新增员工需要提供劳动合同、身份证复印件等材料；减少员工需要提供离职证明等相关材料。

4. 社保缴费基数申报：企业需要在每月规定时间内，根据员工的工资情况，申报社保缴费基数。缴费基数是指员工工资收入的一定比例，用于计算社保缴费金额。

5. 社保费用缴纳：每月扣款期，社保局会根据企业申报的缴费基数，通过银行自动从企业扣费账户中扣除当月社保费用。企业需要确保扣费账户内有足够的资金用于缴纳社保。

6. 缴费查询：企业可以登录海南社保官网或者前往当地社保局查询社保缴费情况。如有问题，可及时与社保局沟通解决。

注意：具体申报扣款流程和所需材料可能因地区和时间而异，请以当地社保局要求为准。