注销公司时，如果签名笔迹不同，一般情况下是可以的。因为在注销过程中，主要关注的是签名人的身份和意愿，而不是笔迹的一致性。

然而，为了确保签名的真实性，有些机构可能会要求提供身份证明或其他相关文件来核实签名人的身份。

因此，在注销公司时，如果出现签名笔迹不同的情况，建议提供必要的身份证明和其他文件，以确保注销流程的顺利进行。同时，具体的注销要求和流程可能因地区而异，建议咨询当地相关机构以获取更准确的信息。