重庆神龙瀑布的水来自于神龙山的山脉和天气条件。神龙山山脉是一个隆起的地质构造，形成了有利于水源形成和聚集的地貌。同时，由于重庆市处于常年亚热带气候，雨量充沛，每年降水量超过1000毫米，许多河流、溪流在高原上分叉，流经山峰、壁谷，在神龙山一带聚集形成了许多山涧和瀑布。因此，重庆神龙瀑布的水是由山涧、雨水等形成的，一年四季瀑布水量都很充足。