北京第三代医保卡的升级可以在多个银行进行，包括但不限于中国银行、中国工商银行、中国农业银行、中国建设银行、中国邮政储蓄银行、北京银行、交通银行、招商银行、北京农商银行、中信银行、光大银行、兴业银行、浦发银行、华夏银行、民生银行、广发银行、平安银行、渤海银行、恒丰银行、北京银联商务有限公司等。

这些银行都设有办理社保卡的业务，您可以根据自己的需求和方便性选择相应的银行进行办理。另外，升级医保卡的具体流程和要求可能因银行和地区而异，建议您在前往银行办理前，先咨询相关银行或社保机构的工作人员，了解具体的办理流程和要求。