羊肚菌在生长过程中，发红可能是由于多种原因引起的。

一种可能的原因是环境温度过高或湿度过低，导致菌根受到伤害，从而出现发红现象。

另一种可能是由于菌根感染了细菌或真菌，或者受到了氧化或其他化学反应的影响，导致菌体细胞变色。此外，孢子的成熟和萌发也可能导致菌体的部分变色。因此，在种植和处理羊肚菌过程中，需要注意合适的环境条件和卫生防护，以避免出现不良现象。