可以确定。

因为高铁建设通常需要在地形比较平缓的地区建设，避免过多加大建设难度和成本，而深沟地区常常是地形较为崎岖陡峭的地区，因此高铁的路线通常会避开这种地形，而选择较为平缓的地区建设。

可以进一步了解的是，遂溪位于广东省江门市西南部，在建设合湛高铁的过程中，有部分路段通过当地村庄，因此可以确定合湛高铁遂溪是经过了深沟的村庄的。