劳动仲裁后，公司上诉不会对公司留案底。劳动仲裁和上诉属于民事纠纷范畴，并非犯罪行为，因此不会产生案底。案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，而在劳动仲裁和上诉过程中，除非涉及虚假诉讼、恶意诉讼等违法行为，否则不会对公司留下案底。

然而，劳动仲裁和上诉的结果可能会对公司的信誉和声誉产生一定影响。如果公司在上诉过程中存在违法行为，可能会受到法律制裁，进而影响公司的信誉和声誉。另外，劳动仲裁和上诉的结果也可能对公司与员工之间的关系产生影响，可能导致员工对公司信任度下降，影响公司的稳定运营。

总之，劳动仲裁后公司上诉不会对公司留案底，但可能会对公司的信誉和声誉产生影响。因此，公司在面临劳动仲裁和上诉时，应积极应对，遵守法律规定，以维护公司形象和稳定运营。